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美NIH应中共要求删除的病毒序列 部分已被恢复

2021年06月25日 4:40 PDF版 分享转发

-CoV-2)在全球大流行的过程中一直在发生突变,研究该病毒早期的对于追查的起源具有重要意义。(中共病毒与基因链示意图)

一年前,美国国家卫生研究院(NIH)曾应中方人员的要求,从一个关键科学数据库中删除了数百个早期中共病毒(SARS-CoV-2​)的基因序列。现在,西雅图的一位研究人员成功恢复了其中13个被删掉的序列。专家称,这些序列表明,疫情在海鲜市场爆发前,SARS-CoV-2病毒已经在其他地方传播了一段时间。

《华尔街日报》周四(24日)报导称,大约一年前,在中国研究人员的要求下,美国国家卫生研究院从一个关键科学数据库中删除了241个早期SARS-CoV-2病毒样本的基因序列。报导称,此举可能让研究疫情起源的科学家无法获得关键信息,令病毒溯源的难度加大。

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NIH随后对外发表声明承认确有其事,但同时也解释说,这些序列是中方研究人员在2020年3月提交给NIH数据库的,但三个月后,该人员提出了删除这些序列的申请。而按照业内常规,“提交数据的研究人员拥有对其数据的相关权利,并且可以要求撤回数据”。

《华日》的报导和NIH的声明都没有提及那名中国研究人员的姓名,但西雅图弗雷德·哈钦森癌症研究中心(Fred Hutchinson Cancer Research Center)的病毒学家杰西·布卢姆(Jesse Bloom)在周二发表的一篇新论文中,提到了上述测序数据提交后又被删除的情况,并披露那些序列数据是武汉人民医院一位名叫傅爱思(音)的科学家收集提交的。

据布卢姆在论文中指出,被删除的数据包括2020年1月至2月期间,在中国武汉市收集的中共肺炎住院患者或疑似病例的病毒样本中提取的基因序列。病毒样本的基因序列可以提供关于SARS-CoV-2病毒是如何从另一种动物(很可能是蝙蝠)转移到人体内的关键线索,而大流行病早期的病毒基因序列可以让科学家更接近病毒起源的真相,中方人员删除这些序列“似乎是为了掩盖它们的存在”。

据这篇论文的叙述,稍早前,布卢姆在审查中共肺炎疫情爆发后各国研究人员公布的病毒基因数据时,看到2020年3月的一项研究中包含了武汉大学科学家收集的241个基因序列的信息。然而当他在一个名为“序列读取档案”(Sequence Read Archive)的在线数据库中寻找这些序列时,却发现相关资料已经被删除了。

布卢姆没有放弃对这些资料的搜寻工作。他搜索大量医学文献后发现,那些遭删除的资料中,有一部分仍可在一份小型期刊上发表的论文中找到。

通过进一步仔细研究档案,布卢姆发现很多序列都以文件的形式存储在谷歌云中的一个文件内,而那些文件的名称都有相同的基本格式。于是,他试着将武汉的一个遗失序列的编码换了进去,竟然从谷歌云中成功恢复了13个被删除的病毒基因序列。

接着,布卢姆将这13个序列与其他已发表的早期冠状病毒序列结合起来研究,希望在构建SARS-CoV-2病毒族谱方面取得进展。结果他发现,2019年12月武汉华南海鲜批发市场暴发疫情初期的一些病毒样本的基因序列显示,这些市场上的病毒有三种额外的突变,而这些突变在几周后从其他地方所收集的SARS-CoV-2样本中是缺失的,包括他从云中恢复的被删除序列也没有这些额外的突变,“它们与蝙蝠冠状病毒的相似度比华南海鲜市场的病毒高三倍”。

上述情况表明,疫情在华南海鲜市场爆发之前,SARS-CoV-2病毒可能已经在武汉的其他地方传播了一段时间了。

《纽约时报》报导称,对于布卢姆的上述发现,亚利桑那大学(University of Arizona)进化生物学家迈克尔·伍罗贝(Michael Worobey)评价说:“这无疑是一项伟大的侦查工作,它大大推进了了解SARS-CoV-2起源的努力。”

来源:新唐人记者竺颖综合报导

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