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先期入住的主要是為運動員入住進行準備並在奧運會期間提供支持的代表團官員。奧運村將於7月13日正式開放，迎來全球各地的運動員。
東京奧運村位於東京灣的晴海，佔地44公頃，其中設有發熱門診。為防範疫情，組織方要求運動員盡量待在奧運村內，奧運會參賽者開賽前提前5天入住，殘奧會參賽者提前7天入住，運動員需要在比賽結束后2天離開奧運村。奧運村入住者每天都需要進行新冠病毒檢測。入住者如要外出，僅可以去提前申請的地點。
東京奧運會將於7月23日開幕，8月8日閉幕。殘奧會則將於8月24日開幕，9月5日閉幕。
另據日媒報道，由於東京等地新冠疫情反覆，日本政府7日決定將再次讓東京都等地進入疫情緊急狀態。6月21日，東京等地的緊急狀態已經解除。