日本先後受到颱風和地震重創，台灣駐日本代表處反應緩慢，沒有第一時間為台胞提供協助，反而是中國外交部調派專車，順道接走滯留關西機場的台灣人，引發輿論批評台灣不只搶邦交國輸給大陸，連救自己僑胞也不及中國積極，台灣外交部官員表達歉意並聲稱會改進。（鍾廣政 台北報道）
強颱風燕子9月4日侵襲日本，造成大阪關西機場封閉，對外交通終斷，大批旅客受困。9月5日凌晨，中國駐日大使館便協調日方，派專車撤離了1044中國旅客，當中還包括：117名香港人、5名澳門人和32名台灣人。
民眾向傳媒投訴，台灣駐日本辦事處事發時沒有主動協助，只表示有需要民眾發電郵提出援助要求，更有旅客反映，打電話到台灣駐日辦事處時，職員態度不佳，沒有提供協助。
輿論和在野黨都諷刺，民進黨政府繼邦交國戰爭輸給北京后，連救自己同胞也敗陣。
國民黨立法院當團書記長曾銘宗表示，在中國大使館協助撤僑時，台灣駐日代表謝長廷在九月五日還有空在臉書發文，批評國民黨主席吳敦義，而不是忙著去幫助受颱風影響的台灣人。
曾銘宗說：謝長廷代表派在日本是在當大官，平常除了發表媚日的言論外，主要是在臉書發表文章攻擊國內的在野黨。假設他無心在日本的外交工作，建議總統府、外交部把他調回來，讓他專心回來拼選舉，回來專心打擊國民黨。
謝長廷接受台灣傳媒訪問時，認為中國派專車去救人是造謠，當天關西機場橋樑終斷，無法對外聯絡。民進黨立委也刊出橋樑被撞斷的航拍照片。傳媒隨即找出相同的航拍照片對比，顯示民進黨出視的照片，是將可以行車的車道部份裁切掉，看起來橋樑像是無法通行。
一名當時滯留關西機場的台灣旅客表示，中國大使館並未派車到關西機場，而是要求日本官方南海電車的交通車，協助派車將中國人載出機場，到泉佐野市時由大陸安排的交通工具送到大阪或新大阪轉車，過程當中並沒有任何人問台胞是哪裡人。
國民黨立法院黨團副書記長陳宜民表示，台灣的駐外單位好像在幫中國大陸做統戰，怪不得大家覺得台胞證愈來愈重要。
陳宜民說：為什麼中國大陸可以有辦法調度15輛大巴士，進入關西的機場疏散中國籍的旅客，但是我們的駐日代表處毫無作為。很多台灣人現在旅遊，身上不只帶著我們的護照，還會帶台胞證，為什麼？因為有時候碰到情況還是可以去尋求對岸的協助，因為對岸可能人力比較充沛，像這次就發生這個狀況，我們的台胞上對岸的大巴士。
台灣外交部亞東及太平洋司參事、兼台灣日本關係協會秘書長張淑玲表示，目前已無台灣民眾滯留在關西機場內。外交部跟謝長廷在災后第一時間，就立即下令相關單位要妥善處理。
張淑玲說：一方面可能是當天急難救助事情較緊急，來洽詢的電話比較多，應對若有不當造成國人觀感不佳的部份，我們還是要深切反醒。以後我們會訓練代表處同仁更有同理心來對待。
在輿論批評后，謝長廷已趕往北海道，協助因地震受困的台灣旅客。但仍有旅客上網尋求協助。受困的林姓旅客表示，看到大陸旅客一早被大型旅遊巴載走，台灣政府至今仍無所作為，目前他們的食水都只靠導遊去與其他災民搶，或是動用關係請人從外地將飯盒送給他們。
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