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法新社报道，盖伊在周二发表的辞职信中说：“我怀着沉重的心情，也怀着对哈佛深深的爱，写信给你们，宣布我将辞去校长职务。”
这位53岁的政治学教授于去年7月成为哈佛大学第一位黑人校长，最近几周一直饱受批评。
盖伊被指没有在自己的论文中妥善引用来源等多项学术著作抄袭指控。
在12月美国众议院教育委员会就美国大学校园反犹太言论与活动举行的听证会上，盖伊因没有明确表明灭绝犹太人的说法违背哈佛校规和行为准则而遭到各界批评。在被问到：校园内反犹言论、甚至扬言要灭绝犹太人的言论是否违背学校规定和行为准则时，盖伊回答说，“可能会，但取决于具体情况”。
盖伊成为汇集了八所著名大学的常春藤盟校第二位辞职的校长。 12月，宾夕法尼亚大学（费城）校长伊丽莎白·马吉尔（Elizabeth Magill）也因在同一听证会上的言论受到批评而辞职。
包括两名民主党议员在内的70多名议员以及前哈佛学生和著名捐助人都呼吁盖伊下台。
盖伊是成立于1636年的哈佛大学任期最短的校长。